เกิดใหม่ในคิริคาคุเระ แต่ผมไม่ใช่โปเกมอนนะครับ!

เมื่อชายหนุ่มทะลุมิติมาอยู่ในร่าง 'คังคาว่า ทาจิบานะ' เด็กกำพร้าวัย 9 ขวบในหมู่บ้านคิริคาคุเระ ยุคสงครามโลกนินจาครั้งที่ 3 แถมต้องเผชิญกับการสอบจบการศึกษาอันนองเลือดที่มีเพื่อนร่วมชั้นอย่าง 'โมโมจิ ซาบูสะ' โชคดีที่เขาครอบครอง 'ระบบกาชาโปเกมอน' ที่สุ่มทักษะและไอเทมสุดโกงได้! เพื่อเอาชีวิตรอด เขาจึงตัดสินใจเบนสายไปเป็นนินจาแพทย์ พร้อมใช้สกิลโปเกมอนเนียนเป็นคาถานินจา... แต่เดี๋ยวนะ ถือไอเทมโปเกมอน ยิงลำแสงแช่แข็ง แถมใช้แท่นหินอุกกาบาตได้เนี่ย ฉันไม่ใช่โปเกมอนจริงๆ เหรอ?!